Theo bản “Lâu Thượng thần tích ngọc phả cổ truyền” có chép rằng: Chùa Bối Linh là nơi bước đầu tập hợp lực lượng cho cuộc khởi nghĩa Hai Bà Trưng. Bối Linh là ngôi chùa cổ lâu đời gắn với nhiều điển tích thời Hùng Vương. Trải qua thời gian và các cuộc chiến tranh chùa đã bị sụp đổ hoàn toàn, chỉ còn lại cổng tam quan. Năm 1992, chùa được phục dựng lại với 01 hậu cung và 3 gian tiền đường để làm nơi lễ bái và sinh hoạt tâm linh. Sau này, chùa được xây dựng thêm nhà Tổ, nhà Mẫu.

Thể theo nguyện vọng của chính quyền và đông đảo nhân dân, Phật tử công trình tu bổ, tôn tạo chùa Bối Linh đã được phê duyệt theo dự toán thiết kế ban đầu với tổng mức đầu tư trên 10 tỷ đồng từ nguồn ngân sách địa ph kinh phí xã hội hóa do các doanh nghiệp, các cơ quan đơn vị, tổ chức, cá nhân, các nhà hảo tâm cùng các tăng ni phật tử phát tâm công đức và nguồn vốn hợp pháp khác. Công trình có quy mô với 2 hạng mục chính là Tam bảo và cổng tam quan dự kiến sẽ hoàn thành trong năm 2025.

Ngôi chùa được trùng tu, tôn tạo không chỉ đáp ứng nguyện vọng của nhân dân địa phương về bảo tồn di tích của địa phương, mà còn góp phần phát huy những giá trị văn hóa tín ngưỡng dân gian của dân tộc, tạo thuận lợi cho các tín đồ, phật tử và nhân dân địa phương thực hành tín ngưỡng thờ cúng mang tính nhân văn sâu sắc.

Tại buổi lễ các chư tôn đức chứng minh và cấp ủy, chính quyền địa phương đã tặng hoa chúc mừng và cùng thực hiện nghi lễ khởi công động thổ, trùng tu tôn tạo chùa Bối Linh.